基于特异性组学和蛋白质组学的高海拔肺动脉高压大鼠模型的新靶点

右心室高压（PH）是常指有规律时平均右心室压≥25 mmHg。 它根据小腿流体动力学特征、病症机制和病症学划分五类。 第三类低纬度右心室高压（HAPH）是由于在低纬度栓塞环境之中肺通气量代偿连续性增加和肺小动脉舒张引起的，造成山岭心肌病。 临床症状都有运动连续性痉挛、头痛和疲累。 HAPH 有可能总结了未能适应低纬度，并会有不清楚的病症生理机制。 大约有 1.4 亿人孤独在沟谷 2,500 米以上的东部，每年有高达 4,000 上千人访问这些低纬度东部。 栓塞造成器官基因强调著者发生差异变转化成； 这大概长期居住在低纬度东部的居民及其祖先的基因型适应连续性变转化成之中得知的。HAPH 的外科手术仍在学术研究之中。应建言患者转至低沟谷东部，氧疗直接。制剂外科手术的学术研究之外一些随机试验。 HAPH 的病症与其他类别的 PH 相似，因此值得考虑对 PAH 直接的制剂应该对 HAPH 直接。

然而，所有这些抗病毒制剂都在HAPH之中的直接连续性和机制尚不清楚。为了解决这个问题，我们力图学术研究栓塞所限于的大分子机制，常用家兔 HAPH 数学方法，并应用综合多第一组学步骤。 在此过程之中，我们力图学术研究几种抗病毒制剂和复氧的作用，以明确低纬度引起的栓塞的潜在新外科手术靶点。 引人注意是，我们学术研究了抗病毒制剂如何影响器官之间的差异基因和氨基酸强调。

学术研究设计：

将家兔置放 10% O2（栓塞）室之中 3 周以产生 PH。对照家兔（C 第一组）在整个实验之中都正处于常氧环境下，并在外科手术在此期间（即从第 21 天开始）用载体进行时外科手术。 3周时，其余家兔随机划分六第一组；一第一组被杀害（第 21 天）以评估心肺机制。其余 5 第一组用抗病毒制剂或复氧外科手术，从第 21 天到第 35 天杀害。慢连续性栓塞，载体处理（M）；慢连续性栓塞，司来帕格外科手术；慢连续性栓塞，奈斯替坦外科手术；慢连续性栓塞，riociguat 外科手术；慢连续性栓塞、复氧 (RE)。

基因强调第一组数据分析：

提取总 RNA，并通过常用 Arraystar rRNA Removal Kit 去除 rRNA 来钼 mRNA 和非编码 RNA。 mRNA 和非编码 RNA 被图片转化成缓冲液转换成图片段（~200-500 nt）。以图片段为COM，利用随机六聚体亚硫酸盐化学合成第一链cDNA。在第二链化学合成过程之中，dTTP 被 dUTP 取代。 然后加入洗清缓冲液以通过一端修复和添加核苷酸来纯转化成和除去图片段。 图片段被纯转化成并与接头连接； 常用嘧啶-N-糖基转化成酶消转化成第二条链。 琼脂糖凝胶电泳后，选择恰当的图片作为COM进行时PCR扩增。 常用 Agilent 2100 生物数据探头和 ABI StepOnePlus 实时 PCR 系统对容器库进行时定量和数量级评估。 该月刊常用 Illumina HiSeq 2000 系统进行时测序。

LC-MS/MS 数据分析

在连接到 Easy-nLC 1000 液相色著者系统的Q Exactive HF 核磁共振上数据分析容器。将干燥的氨基酸容器继续溶解在乙醇 A（0.1% 甲酸水溶液）之中并读取到捕集柱之中常用乙醇 A 的最大压力为 280 bar，然后在自制的 150 μm × 30 cm 硅胶微柱上以 5–35% 的梯度进行时除去悬浮相 B（乙腈和 0.1% 甲酸），流速为 600 nl/min，持续 150 分钟。 QE HF 的 MS 数据分析是在 3e6 离子的自动增益控制目标下进行时一次全扫描，然后进行时多达 30 次与信息系统性的 MS/MS 扫描有着较低能量的相撞水合，在 Orbitrap 之中检查到（R = 15,000 在 200 m/z）。

学术研究结果：

基于RNA-seq信息的共强调网络的机制钼数据分析和枢纽大分子确认。

基于氨基酸信息的共强调网络的机制钼数据分析和枢纽大分子确认。

RNA-seq 和氨基酸第一组学揭示了对三种制剂的催转化成之间的强系统性连续性，有着几乎相同的效果。GO 钼显示差异强调的基因都有参予代谢适度、基因强调和英文翻译的基因。

司来帕格、奈斯替坦和复氧可改善 HAPH。Serpina1、Cryz 和 Cmc1 被确认出来，通过多第一组学筛选，作为参予HAPH的关键基因。这些发掘出为 HAPH 的抗病毒制剂机制透过了最初见解。

学术研究结论：

Selexipag、macitentan 和复氧显着消散了家兔 HAPH 数学方法，而 riociguat 的作用较弱。 差异强调的基因参予代谢调控、基因强调和英文翻译。 某些氨基酸受到 HAPH 和外科手术的影响。 我们常用多第一组学步骤筛选了关键基因 Serpina1、Cryz 和 Cmc1。 这些发掘出有可能有助于更好地了解栓塞所限于的大分子机制，并有可能透过最初外科手术靶点。

文献出处：

Xu X, Li H, Wei Q, Li X, Shen Y, Guo G, Chen Y, He K, Liu C. Novel Targets in a High-Altitude Pulmonary Hypertension Rat Model Based on RNA-seq and Proteomics. Front Med (Lausanne). 2021 Nov 3;8:742436. doi: 10.3389/fmed.2021.742436. PMID: 34805208; PMCID: PMC8595261.